近年来研究所共获得国家、省部级以上各类奖励多项，其中包括国家科学技术进步一等奖、国家技术发明二等奖；在酵母生物炼制核苷酸技术、微流芯片技术、生物基富马酸的高效制备技术等填补国内空白，并达到国际先进水平；承担国家“863”、“973”、国家重大专项、国家科技支撑计划等国家级科研项目多项，获得各类科研经费逾亿元。研究所年申请各类专利多项，现有授权专利多项。